През 1960 година група млади привърженици на астрономията създали във Варна Клуб по астронавтика и астрономия. Този техен интерес бил породен от изстрелването на първия изкуствен спътник на Земята. 

През 1963 година  варненската община предоставя на този клуб, сграда намираща се в централната част на Морската градина. В нея започват да се провеждат и първите курсове  по астрономия и ракетомоделизъм. С времето се родила идеята и за създаването на астрономическа обсерватория. И така малко по-късно  на 22 май 1968 година бил открит за първи път в България комплекс състоящ се от обсерватория, планетариум със Звездна зала и кула с махало на Фуко. Комплекса бил именуван на великия полския учен Николай Коперник. Негов паметник е издигнат пред входа на планетариума.

Основната научната дейност на обсерваторията се състои в това да наблюдава изкуствените спътници на земята и да ги заснема. А също така учените са си поставили задачата да популяризират  астрономията  сред  гражданите  чрез водене на лекции, прожекции в Звездната зала, наблюдения с телескоп на различни небесни тела и чрез статии и публикации  в различни специализирани  периодични издания и списания. Също така се организират  и астрономически курсове за най-запалените почитатели на звездите и планетите, както и любителски курсове.

В първите години от създаването си, оборудването на планетариума било много скромно, но с  течение на времето  техниката се увеличила, а старата апаратура се заменила с нова, за да се превърне днес обсерваторията в една от най-модерните на Балканите. В кулата, където е направено прословутото махало на  Фуко  е единствено по рода си на Балканския полуостров, защото  само чрез него се доказва въртенето на Земята около оста й.

Към края на 1998 година започва ремонт на сградата на планетариума, който завършва след цели 4 години, поради финансови проблеми.  След ремонта в помещенията под кулата  са изградени зала за лекции по астрономия, компютърна зала и библиотека. След завършването на  ремонтните дейности обсерваторията била изцяло обновена  и модернизирана и получила  нов, по-красив и съвременен  вътрешен и външен вид.

Около цялата сграда е поставено осветление, което вечер я откроява  от всичко наоколо в Морската градина.